Akens
FTDNA: 404505, BigY2: 404505MDKA Birth:

Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 404505 | BigY2 404505 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6401997-C-A | 6533956-C-A | A* | ||||||||
25947472-G-C | 23801325-G-C | P1_Y1 | *** | A* | ||||||
28785774-G-C | 26639627-G-C | A* | ||||||||
8698208-G-A | 8830167-G-A | Y64351 | Y | Y | + | + | ||||
9773788-T-G | 9936179-T-G | Y65180 | Y | + | + | |||||
13194920-AC-A | 11039244-AC-A | *** | + | |||||||
19104305-G-A | 16992425-G-A | Y74639 | Y | Y | + | + | ||||
13448697-TC-T | 11293021-TC-T | * | ||||||||
7669344-AT-A | 7801303-AT-A | 10×T | * | |||||||
22345561-G-A | 20183675-G-A | BY10064 | DYZ19 | *** | * | |||||
14788025-T-A | 12676096-T-A | ** | ||||||||
56871652-GAGA-T | ** | |||||||||
14803022-A-G | 12691093-A-G | ** | ||||||||
14727227-T-C | 12615295-T-C | ** | ||||||||
14994178-T-C | 12882263-T-C | ** | ||||||||
14994310-T-C | 12882395-T-C | ** | ||||||||
15106768-A-T | 12994856-A-T | ** | ||||||||
15107106-A-G | 12995193-A-G | Y67738 | ** | |||||||
15111623-C-T | 12999710-C-T | ** | ||||||||
15127913-C-G | 13016000-C-G | ** | ||||||||
15138200-A-T | 13026287-A-T | ** | ||||||||
15138201-T-G | 13026288-T-G | ** | ||||||||
14787982-A-G | 12676053-A-G | ** | ||||||||
14623258-A-G | 12511456-A-G | ** | ||||||||
14715040-G-T | 12603107-G-T | ** | ||||||||
14526459-C-A | 12414660-C-A | ** | ||||||||
14431480-G-A | 12310753-G-A | ** | ||||||||
14463543-C-A | 12342816-C-A | ** | ||||||||
14492617-G-T | 12380814-G-T | ** | ||||||||
14505339-CAA-C | 12393544-CAA-C | 12×A | ** | |||||||
14507805-C-A | 12396010-C-A | ** | ||||||||
14524134-T-A | 12412335-T-A | ** | ||||||||
14525549-C-G | 12413750-C-G | ** | ||||||||
14526611-C-A | 12414812-C-A | ** | ||||||||
14668346-T-C | 12556412-T-C | ** | ||||||||
14559158-G-A | 12447359-G-A | ** | ||||||||
14562927-C-A | 12451127-C-A | ** | ||||||||
14586135-G-T | 12474335-G-T | ** | ||||||||
14605273-T-C | 12493475-T-C | ** | ||||||||
14609781-C-A | 12497983-C-A | ** | ||||||||
14619446-A-G | 12507644-A-G | ** | ||||||||
14620817-T-A | 12509015-T-A | ** | ||||||||
15140848-G-A | 13028935-G-A | ** | ||||||||
15377104-G-A | 13265224-G-A | ** | ||||||||
15140863-T-G | 13028950-T-G | ** | ||||||||
16572765-C-A | 14460885-C-A | ** | ||||||||
16177254-C-A | 14065374-C-A | ** | ||||||||
16277857-C-A | 14165977-C-A | ** | ||||||||
16344549-C-A | 14232669-C-A | ** | ||||||||
16413383-A-T | 14301503-A-T | Y69844 | ** | |||||||
16413532-A-G | 14301652-A-G | ** | ||||||||
16491254-C-A | 14379374-C-A | ** | ||||||||
16665502-A-C | 14553622-A-C | ** | ||||||||
16063606-C-T | 13951726-C-T | ** | ||||||||
16679265-C-A | 14567385-C-A | ** | ||||||||
16702313-G-A | 14590433-G-A | ** | ||||||||
16932952-TC-T | 14821072-TC-T | ** | ||||||||
16938306-G-C | 14826426-G-C | ** | ||||||||
17038341-T-C | 14926461-T-C | ** | ||||||||
17088948-C-T | 14977068-C-T | ** | ||||||||
16066690-G-T | 13954810-G-T | ** | ||||||||
16047714-C-A | 13935834-C-A | ** | ||||||||
15140901-T-C | 13028988-T-C | ** | ||||||||
15682361-C-A | 13570481-C-A | ** | ||||||||
15173613-C-A | 13061699-C-A | ** | ||||||||
15212510-C-A | 13100596-C-A | ** | ||||||||
14356261-G-A | 12235556-G-A | ** | ||||||||
15386336-C-T | 13274456-C-T | ** | ||||||||
15431909-C-A | 13320029-C-A | ** | ||||||||
15597661-G-T | 13485781-G-T | ** | ||||||||
15698957-C-A | 13587077-C-A | ** | ||||||||
16017501-A-G | 13905621-A-G | ** | ||||||||
15755197-C-A | 13643317-C-A | ** | ||||||||
15870591-C-T | 13758711-C-T | ** | ||||||||
15952694-A-G | 13840814-A-G | ** | ||||||||
16002481-C-A | 13890601-C-A | ** | ||||||||
16005444-C-A | 13893564-C-A | ** | ||||||||
16012273-T-A | 13900393-T-A | ** | ||||||||
16014844-C-A | 13902964-C-A | ** | ||||||||
14366524-C-A | 12245819-C-A | ** | ||||||||
14198345-C-A | 12077639-C-A | ** | ||||||||
14344939-C-A | 12224234-C-A | ** | ||||||||
11032484-C-A | ** | |||||||||
10997903-C-A | ** | |||||||||
10998309-T-G | ** | |||||||||
11000034-CA-C | ** | |||||||||
11000041-T-C | ** | |||||||||
11027072-T-C | ** | |||||||||
11028224-CCACTT-C | ** | |||||||||
11034803-C-A | ** | |||||||||
10983871-C-A | ** | |||||||||
11034801-CTCCTT-C | ** | |||||||||
11034824-C-A | ** | |||||||||
11034835-A-T | ** | |||||||||
11034862-G-C | ** | |||||||||
11034909-G-C | ** | |||||||||
11034915-C-T | ** | |||||||||
10987322-T-C | ** | |||||||||
10978826-C-A | BY29404 | ** | ||||||||
13207767-G-A | 11052091-G-A | ** | ||||||||
10949270-A-T | ** | |||||||||
10912782-G-A | ** | |||||||||
10915121-G-T | ** | |||||||||
10937339-C-A | ** | |||||||||
10940342-A-C | ** | |||||||||
10945933-G-T | ** | |||||||||
10946573-C-A | ** | |||||||||
59030589-G-T | 56884442-G-T | ** | ||||||||
10968779-G-T | ** | |||||||||
10949345-T-C | ** | |||||||||
10949347-T-C | ** | |||||||||
10949367-C-T | ** | |||||||||
10949373-A-C | ** | |||||||||
10952149-C-T | ** | |||||||||
10955307-A-T | ** | |||||||||
13200388-C-A | 11044712-C-A | ** | ||||||||
13213434-C-A | 11057758-C-A | ** | ||||||||
14295524-C-A | 12174818-C-A | ** | ||||||||
14146956-GA-G | 12026250-GA-G | ** | ||||||||
13856970-T-A | 11736264-T-A | ** | ||||||||
13887484-G-A | 11766778-G-A | ** | ||||||||
13889308-T-G | 11768602-T-G | ** | ||||||||
13940285-G-A | 11819579-G-A | ** | ||||||||
13976031-C-A | 11855325-C-A | ** | ||||||||
14000289-A-G | 11879583-A-G | ** | ||||||||
14147948-G-A | 12027242-G-A | ** | ||||||||
13855946-A-T | 11735240-A-T | ** | ||||||||
14147992-G-A | 12027286-G-A | ** | ||||||||
14161987-A-G | 12041281-A-G | ** | ||||||||
17098217-T-G | 14986337-T-G | ** | ||||||||
14213724-A-T | 12093018-A-T | ** | ||||||||
14219674-C-A | 12098968-C-A | ** | ||||||||
14239319-C-A | 12118613-C-A | ** | ||||||||
13856139-T-C | 11735433-T-C | ** | ||||||||
13855323-C-A | 11734617-C-A | ** | ||||||||
13216492-C-A | 11060816-C-A | ** | ||||||||
13488824-A-T | 11333148-A-T | ** | ||||||||
13461017-A-G | 11305341-A-G | ** | ||||||||
13461083-G-C | 11305407-G-C | ** | ||||||||
13472203-CAG-C | 11316527-CAG-C | ** | ||||||||
13472207-CCCA-C | 11316531-CCCA-C | ** | ||||||||
13480898-C-A | 11325222-C-A | ** | ||||||||
13488799-A-G | 11333123-A-G | ** | ||||||||
13554982-C-A | 11399306-C-A | ** | ||||||||
13809382-C-A | 11688676-C-A | ** | ||||||||
13579712-A-G | 11424036-A-G | ** | ||||||||
13611988-G-GTTT | 11456312-G-GTTT | 19×T | ** | |||||||
13625751-C-G | 11470075-C-G | ** | ||||||||
13637356-C-A | 11481680-C-A | ** | ||||||||
11645208-A-T | ** | |||||||||
11667595-G-T | ** | |||||||||
11675531-G-T | ** | |||||||||
17095330-C-A | 14983450-C-A | ** | ||||||||
17246981-T-C | 15135101-T-C | ** | ||||||||
17098305-G-C | 14986425-G-C | ** | ||||||||
23181450-AT-A | 21019564-AT-A | ** | ||||||||
22994816-T-C | 20832930-T-C | ** | ||||||||
22995478-T-G | 20833592-T-G | ** | ||||||||
22996042-A-T | 20834156-A-T | ** | ||||||||
22996046-A-T | 20834160-A-T | ** | ||||||||
23111791-C-A | 20949905-C-A | ** | ||||||||
23167954-C-A | 21006068-C-A | ** | ||||||||
23342101-G-A | 21180215-G-A | ** | ||||||||
22994805-A-T | 20832919-A-T | ** | ||||||||
23411435-C-T | 21249549-C-T | ** | ||||||||
23435837-C-A | 21273951-C-A | ** | ||||||||
23786392-C-A | 21624506-C-A | ** | ||||||||
23837769-A-C | 21675883-A-C | ** | ||||||||
21753767-G-T | ** | |||||||||
23997419-G-T | 21851272-G-T | ** | ||||||||
22994810-T-C | 20832924-T-C | ** | ||||||||
22797979-G-T | 20636093-G-T | ** | ||||||||
24264559-A-C | 22118412-A-C | P3_b1 | ** | |||||||
22169760-C-T | 20007874-C-T | ** | ||||||||
21946401-T-C | 19784515-T-C | ** | ||||||||
21946457-C-A | 19784571-C-A | ** | ||||||||
21954644-A-T | 19792758-A-T | ** | ||||||||
21972273-TTATTCAGC-T | 19810387-TTATTCAGC-T | ** | ||||||||
21991517-G-C | 19829631-G-C | ** | ||||||||
22155694-G-A | 19993808-G-A | ** | ||||||||
22211379-A-T | 20049493-A-T | ** | ||||||||
22782885-G-A | 20620999-G-A | ** | ||||||||
22232887-G-T | 20071001-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
22517339-C-A | 20355453-C-A | ** | ||||||||
22520559-C-T | 20358673-C-T | ** | ||||||||
22548264-C-A | 20386378-C-A | ** | ||||||||
22635000-G-A | 20473114-G-A | ** | ||||||||
22703584-A-G | 20541698-A-G | ** | ||||||||
24264415-C-T | 22118268-C-T | P3_b1 | ** | |||||||
24266708-T-TC | 22120561-T-TC | P3_b1 | ** | |||||||
21821412-G-T | 19659526-G-T | ** | ||||||||
28630427-T-C | 26484280-T-C | ** | ||||||||
28516794-C-A | 26370647-C-A | ** | ||||||||
28532729-C-A | 26386582-C-A | ** | ||||||||
28591260-C-A | 26445113-C-A | ** | ||||||||
28605326-T-A | 26459179-T-A | ** | ||||||||
28605351-C-G | 26459204-C-G | ** | ||||||||
28622158-AAAAT-A | 26476011-AAAAT-A | 5×AAAT | ** | |||||||
28692667-T-C | 26546520-T-C | ** | ||||||||
28479109-C-G | 26332962-C-G | ** | ||||||||
28714945-C-A | 26568798-C-A | ** | ||||||||
28755705-C-A | 26609558-C-A | ** | ||||||||
28771677-C-A | 26625530-C-A | ** | ||||||||
28777304-C-A | 26631157-C-A | ** | ||||||||
56844434-T-C | ** | |||||||||
56849831-A-T | ** | |||||||||
28483573-C-A | 26337426-C-A | ** | ||||||||
28479062-C-A | 26332915-C-A | ** | ||||||||
24302769-C-G | 22156622-C-G | P3_t1 | ** | |||||||
25909541-G-T | 23763394-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
24432628-A-T | 22286481-A-T | ** | ||||||||
24518533-T-G | 22372386-T-G | ** | ||||||||
24518544-C-G | 22372397-C-G | ** | ||||||||
24518548-A-T | 22372401-A-T | ** | ||||||||
24880341-T-G | 22734194-T-G | g1 | ** | |||||||
25909530-A-T | 23763383-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
25909556-T-A | 23763409-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27627628-G-T | 25481481-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
25926027-ACC-A | 23779880-ACC-A | P1_Y1 | ** | |||||||
25967594-T-A | 23821447-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
25967653-T-C | 23821506-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
25967670-T-A | 23821523-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26046021-G-T | 23899874-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26170594-G-A | 24024447-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27423663-A-C | 25277516-A-C | P1_g3 | ** | |||||||
21861415-G-C | 19699529-G-C | ** | ||||||||
21802900-C-A | 19641014-C-A | ** | ||||||||
17130434-C-A | 15018554-C-A | ** | ||||||||
18636612-CTTTTTTT-C | 16524732-CTTTTTTT-C | 17×T | ** | |||||||
18050395-C-CT | 15938515-C-CT | 8×T | ** | |||||||
18079258-C-T | 15967378-C-T | ** | ||||||||
18147541-A-C | 16035661-A-C | ** | ||||||||
18410864-G-T | 16298984-G-T | P6_Gap | ** | |||||||
18443472-A-C | 16331592-A-C | P6_Dst | ** | |||||||
18544849-T-C | 16432969-T-C | ** | ||||||||
18754844-A-T | 16642964-A-T | ** | ||||||||
17776945-A-C | 15665065-A-C | ** | ||||||||
18768279-TG-T | 16656399-TG-T | ** | ||||||||
18793635-G-T | 16681755-G-T | ** | ||||||||
18841112-TAAAA-T | 16729232-TAAAA-T | 16×A | ** | |||||||
18848490-T-G | 16736610-T-G | ** | ||||||||
18902030-C-A | 16790150-C-A | ** | ||||||||
18929947-C-A | 16818067-C-A | ** | ||||||||
17865409-A-G | 15753529-A-G | ** | ||||||||
17776942-G-A | 15665062-G-A | ** | ||||||||
19254393-T-C | 17142513-T-C | ** | ||||||||
17581763-G-T | 15469883-G-T | ** | ||||||||
17183149-TC-T | 15071269-TC-T | ** | ||||||||
17211217-TTCAAGCGGGATTGGGGCAGAGTGGGAAATTAGAG-T | 15099337-TTCAAGCGGGATTGGGGCAGAGTGGGAAATTAGAG-T | ** | ||||||||
10900700-C-A | ** | |||||||||
17490004-C-A | 15378124-C-A | ** | ||||||||
17547554-C-A | 15435674-C-A | ** | ||||||||
17571954-G-A | 15460074-G-A | ** | ||||||||
17707257-G-A | 15595377-G-A | ** | ||||||||
17713848-TTC-T | 15601968-TTC-T | ** | ||||||||
17707270-G-A | 15595390-G-A | ** | ||||||||
17707271-G-A | 15595391-G-A | ** | ||||||||
17707274-G-A | 15595394-G-A | ** | ||||||||
17707282-C-T | 15595402-C-T | ** | ||||||||
17707284-G-T | 15595404-G-T | ** | ||||||||
17707291-G-T | 15595411-G-T | ** | ||||||||
17707294-G-T | 15595414-G-T | ** | ||||||||
19085797-T-C | 16973917-T-C | ** | ||||||||
19275211-C-A | 17163331-C-A | ** | ||||||||
21786087-C-A | 19624201-C-A | ** | ||||||||
21262480-C-A | 19100594-C-A | ** | ||||||||
21133511-C-A | 18971625-C-A | ** | ||||||||
21133556-C-T | 18971670-C-T | 23×A | ** | |||||||
21141425-T-C | 18979539-T-C | ** | ||||||||
21155250-C-A | 18993364-C-A | ** | ||||||||
21162847-C-A | 19000961-C-A | ** | ||||||||
21238310-A-G | 19076424-A-G | ** | ||||||||
21435334-C-A | 19273448-C-A | ** | ||||||||
21042389-G-A | 18880503-G-A | FGC73410 Y75719 | ** | |||||||
21488998-C-A | 19327112-C-A | ** | ||||||||
21544746-C-A | 19382860-C-A | ** | ||||||||
21554268-C-A | 19392382-C-A | ** | ||||||||
21603966-T-TAA | 19442080-T-TAA | 11×A | ** | |||||||
21672265-C-G | 19510379-C-G | ** | ||||||||
21678234-C-A | 19516348-C-A | ** | ||||||||
21120748-G-T | 18958862-G-T | ** | ||||||||
20970354-A-AT | 18808468-A-AT | P4_Dst | ** | |||||||
19299759-A-C | 17187879-A-C | ** | ||||||||
19646339-G-T | 17534459-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19324173-G-A | 17212293-G-A | ** | ||||||||
19351428-C-A | 17239548-C-A | ** | ||||||||
19376262-G-T | 17264382-G-T | ** | ||||||||
19389670-A-C | 17277790-A-C | ** | ||||||||
19552056-AGCATGATTTACAATCCTTT-A | 17440176-AGCATGATTTACAATCCTTT-A | ** | ||||||||
19610293-C-A | 17498413-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19663186-G-A | 17551306-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
20622535-A-G | 18460649-A-G | P4_Prx | ** | |||||||
19675460-C-A | 17563580-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19770083-C-A | 17658203-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19781319-T-A | 17669439-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20326037-G-TTT | 18164151-G-TTT | P5_Dst | ** | |||||||
20377719-G-T | 18215833-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20593057-A-AG | 18431171-A-AG | P5_Dst | ** | |||||||
20613622-T-A | 18451736-T-A | P4_Prx | ** | |||||||
10905621-G-T | ** | |||||||||
10949339-T-TGTCTG | ** | |||||||||
10894476-C-A | ** | |||||||||
4445056-C-T | 4577015-C-T | ** | ||||||||
4236856-G-C | 4368815-G-C | ** | ||||||||
4327423-C-A | 4459382-C-A | ** | ||||||||
4332141-C-T | 4464100-C-T | ** | ||||||||
4412590-A-C | 4544549-A-C | ** | ||||||||
4416887-A-T | 4548846-A-T | ** | ||||||||
4431798-G-T | 4563757-G-T | ** | ||||||||
4504291-C-A | 4636250-C-A | ** | ||||||||
4140700-G-A | 4272659-G-A | ** | ||||||||
4512112-T-A | 4644071-T-A | ** | ||||||||
4665826-C-A | 4797785-C-A | ** | ||||||||
4665855-C-A | 4797814-C-A | ** | ||||||||
4668235-A-G | 4800194-A-G | ** | ||||||||
4687384-T-G | 4819343-T-G | ** | ||||||||
4707176-C-A | 4839135-C-A | ** | ||||||||
4159787-C-A | 4291746-C-A | ** | ||||||||
4138519-T-G | 4270478-T-G | ** | ||||||||
4840177-C-A | 4972136-C-A | ** | ||||||||
3743929-G-T | 3875888-G-T | ** | ||||||||
3528322-C-CT | 3660281-C-CT | 12×T | ** | |||||||
3545595-T-A | 3677554-T-A | ** | ||||||||
3547306-C-A | 3679265-C-A | ** | ||||||||
3605978-T-A | 3737937-T-A | ** | ||||||||
3620660-G-C | 3752619-G-C | ** | ||||||||
3732952-C-T | 3864911-C-T | 14×T | ** | |||||||
3758722-T-C | 3890681-T-C | ** | ||||||||
4137190-G-T | 4269149-G-T | ** | ||||||||
3833969-CCA-C | 3965928-CCA-C | ** | ||||||||
3889721-C-A | 4021680-C-A | ** | ||||||||
3905570-C-A | 4037529-C-A | ** | ||||||||
4062549-C-G | 4194508-C-G | FGC58606 | ** | |||||||
4062577-G-C | 4194536-G-C | ** | ||||||||
4113130-AAA-G | 4245089-AAA-G | ** | ||||||||
4740791-C-A | 4872750-C-A | ** | ||||||||
4882336-A-G | 5014295-A-G | ** | ||||||||
3467797-G-T | 3599756-G-T | ** | ||||||||
6212446-C-G | 6344405-C-G | IR3_Dst | ** | |||||||
5645178-A-T | 5777137-A-T | ** | ||||||||
5654158-C-A | 5786117-C-A | ** | ||||||||
5675349-T-C | 5807308-T-C | ** | ||||||||
5687442-C-A | 5819401-C-A | ** | ||||||||
6107856-C-T | 6239815-C-T | ** | ||||||||
10892204-T-G | ** | |||||||||
6212464-G-C | 6344423-G-C | IR3_Dst | ** | |||||||
5523746-T-A | 5655705-T-A | ** | ||||||||
6212475-T-C | 6344434-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6212490-A-T | 6344449-A-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6406434-C-T | 6538393-C-T | ** | ||||||||
6514262-G-T | 6646221-G-T | ** | ||||||||
6519502-C-G | 6651461-C-G | ** | ||||||||
6519511-C-T | 6651470-C-T | ** | ||||||||
5620371-C-A | 5752330-C-A | ** | ||||||||
5460484-C-T | 5592443-C-T | ** | ||||||||
4882342-T-G | 5014301-T-G | ** | ||||||||
5080434-T-C | 5212393-T-C | ** | ||||||||
4888443-A-G | 5020402-A-G | ** | ||||||||
4888447-T-G | 5020406-T-G | ** | ||||||||
4936641-C-A | 5068600-C-A | ** | ||||||||
4937117-C-A | 5069076-C-A | ** | ||||||||
4968332-A-G | 5100291-A-G | ** | ||||||||
5017662-G-A | 5149621-G-A | ** | ||||||||
5129156-C-A | 5261115-C-A | ** | ||||||||
5421027-C-A | 5552986-C-A | ** | ||||||||
5177461-A-T | 5309420-A-T | ** | ||||||||
5189463-C-G | 5321422-C-G | ** | ||||||||
5199730-C-A | 5331689-C-A | ** | ||||||||
5200173-C-A | 5332132-C-A | ** | ||||||||
5247669-A-G | 5379628-A-G | ** | ||||||||
5367799-G-T | 5499758-G-T | ** | ||||||||
5387712-T-C | 5519671-T-C | ** | ||||||||
3476170-G-T | 3608129-G-T | ** | ||||||||
3463095-G-T | 3595054-G-T | ** | ||||||||
6663861-G-T | 6795820-G-T | ** | ||||||||
13564521-C-A | 11408845-C-A | ** | ||||||||
17004511-C-A | 14892631-C-A | ** | ||||||||
16572932-AACAC-A | 14461052-AACAC-A | 13×AC | ** | |||||||
6231178-GAA-G | 6363137-GAA-G | IR3_Dst | 12×A | ** | ||||||
17843091-ATTTTT-A | 15731211-ATTTTT-A | 18×T | ** | |||||||
6720393-AT-A | 6852352-AT-A | 10×T | ** | |||||||
10765756-C-T | ** | |||||||||
3598985-C-A | 3730944-C-A | ** | ||||||||
9956299-G-A | 10118690-G-A | ** | ||||||||
10845675-C-CT | ** | |||||||||
10845679-T-TAATA | ** | |||||||||
10845700-C-G | ** | |||||||||
10845701-C-A | ** | |||||||||
10842561-T-C | ** | |||||||||
10842579-CT-C | ** | |||||||||
23223294-T-C | 21061408-T-C | ** | ||||||||
22815505-G-T | 20653619-G-T | 20×T | ** | |||||||
13480582-C-A | 11324906-C-A | ** | ||||||||
23311288-G-T | 21149402-G-T | ** | ||||||||
13488789-G-C | 11333113-G-C | ** | ||||||||
7370029-C-A | 7501988-C-A | ** | ||||||||
6157875-AT-A | 6289834-AT-A | IR3_Dst | 17×T | ** | ||||||
4872610-C-A | 5004569-C-A | ** | ** | |||||||
16364099-TATATATATATATAC-T | 14252219-TATATATATATATAC-T | ** | ||||||||
17085714-C-T | 14973834-C-T | ** | ||||||||
59017780-T-A | 56871633-T-A | ** | ||||||||
28580001-G-T | 26433854-G-T | CTS12340 | ** | |||||||
4951459-C-T | 5083418-C-T | ** | ||||||||
3688970-C-A | 3820929-C-A | Y5166 | ** | |||||||
6771598-T-C | 6903557-T-C | CTS471 | ** | ** | ||||||
18653213-T-C | 16541333-T-C | ** | ||||||||
21042400-T-A | 18880514-T-A | ** | ||||||||
21416552-G-A | 19254666-G-A | Y12411 Z28458 | ** | |||||||
59017781-AT-A | 56871634-AT-A | ** | ||||||||
9438099-CTTTTT-C | 9600490-CTTTTT-C | 30×T | ** | |||||||
13975860-C-A | 11855154-C-A | ** | ||||||||
3463002-T-C | 3594961-T-C | ** | ||||||||
3273213-C-A | 3405172-C-A | ** | ||||||||
3108250-G-T | 3240209-G-T | ** | ||||||||
3131722-G-C | 3263681-G-C | ** | ||||||||
3148129-T-C | 3280088-T-C | ** | ||||||||
3218527-C-G | 3350486-C-G | ** | ||||||||
3226341-A-G | 3358300-A-G | ** | ||||||||
3272919-T-C | 3404878-T-C | ** | ||||||||
3286623-C-A | 3418582-C-A | ** | ||||||||
2975540-T-C | 3107499-T-C | ** | ||||||||
3332560-C-A | 3464519-C-A | ** | ||||||||
3373803-G-T | 3505762-G-T | ** | ||||||||
3384900-C-A | 3516859-C-A | ** | ||||||||
3400930-G-T | 3532889-G-T | ** | ||||||||
3412623-G-T | 3544582-G-T | ** | ||||||||
3435788-C-A | 3567747-C-A | ** | ||||||||
2978722-C-A | 3110681-C-A | ** | ||||||||
2961672-G-T | 3093631-G-T | ** | ||||||||
3883368-GA-G | 4015327-GA-G | 11×A | ** | |||||||
21134925-A-ATT | 18973039-A-ATT | 22×T | ** | |||||||
11027101-A-C | ** | |||||||||
13961423-C-A | 11840717-C-A | ** | ||||||||
10677917-T-A | ** | |||||||||
10677949-G-C | ** | |||||||||
10677951-C-G | ** | |||||||||
10766039-C-A | ** | |||||||||
2708452-G-T | 2840411-G-T | ** | ||||||||
2960006-A-G | 3091965-A-G | ** | ||||||||
2744959-G-T | 2876918-G-T | ** | ||||||||
2760002-C-A | 2891961-C-A | ** | ||||||||
2843070-C-A | 2975029-C-A | Y81598 | ** | |||||||
2866462-C-T | 2998421-C-T | ** | ||||||||
2900286-A-G | 3032245-A-G | ** | ||||||||
2907008-C-A | 3038967-C-A | ** | ||||||||
2947894-C-A | 3079853-C-A | ** | ||||||||
6585434-T-C | 6717393-T-C | ** | ||||||||
6119358-T-A | 6251317-T-A | ** | ||||||||
6691350-G-T | 6823309-G-T | ** | ||||||||
10756534-A-C | ** | |||||||||
10770328-TTC-T | ** | |||||||||
10770322-ATTC-A | ** | |||||||||
10768119-T-TG | ** | |||||||||
10768092-A-T | ** | |||||||||
10768083-C-G | ** | |||||||||
10765767-T-C | ** | |||||||||
10765754-C-T | ** | |||||||||
10763438-G-C | ** | |||||||||
10763163-C-CTCCACTCCACTCCAT | ** | |||||||||
10761033-C-A | ** | |||||||||
10756584-C-A | ** | |||||||||
10756567-T-C | ** | |||||||||
10756560-A-T | ** | |||||||||
10756547-T-A | ** | |||||||||
10756533-G-T | ** | |||||||||
10770373-T-C | ** | |||||||||
10746652-C-A | ** | |||||||||
10672855-C-A | ** | |||||||||
10672853-C-A | ** | |||||||||
10669069-T-G | ** | |||||||||
10669063-A-T | ** | |||||||||
10668988-A-G | ** | |||||||||
10668950-T-A | ** | |||||||||
10668936-G-A | ** | |||||||||
10668935-T-A | ** | |||||||||
10668528-G-T | ** | |||||||||
10665061-TC-T | ** | |||||||||
10034508-C-G | 10196899-C-G | ** | ||||||||
9985986-G-T | 10148377-G-T | ** | ||||||||
9967107-C-A | 10129498-C-A | ** | ||||||||
10770368-T-C | ** | |||||||||
10776116-A-T | ** | |||||||||
9946053-C-T | 10108444-C-T | ** | ||||||||
10826744-C-A | ** | |||||||||
10889236-T-G | ** | |||||||||
10887641-A-C | ** | |||||||||
10886775-G-T | ** | |||||||||
10875937-A-C | ** | |||||||||
10868787-C-A | ** | |||||||||
10868747-C-G | ** | |||||||||
10868064-C-A | ** | |||||||||
10862189-C-A | ** | |||||||||
10848812-C-A | ** | |||||||||
10842576-A-AC | ** | |||||||||
10841065-TCCACC-T | ** | |||||||||
10841059-T-C | ** | |||||||||
10841050-T-G | ** | |||||||||
10836943-C-A | ** | |||||||||
10812604-C-T | ** | |||||||||
10776457-T-C | ** | |||||||||
10792463-A-T | ** | |||||||||
10779863-G-T | ** | |||||||||
10781755-CTG-C | ** | |||||||||
10789146-A-G | ** | |||||||||
10789162-C-A | ** | |||||||||
10792230-T-C | ** | |||||||||
10792456-C-G | ** | |||||||||
10793072-C-T | ** | |||||||||
10808290-C-A | ** | |||||||||
10793076-T-G | ** | |||||||||
10793097-T-C | ** | |||||||||
10793122-C-T | ** | |||||||||
10793134-A-G | ** | |||||||||
10793135-A-C | ** | |||||||||
10802186-C-A | ** | |||||||||
9956551-A-G | 10118942-A-G | ** | ||||||||
10692729-C-A | ** | |||||||||
9941438-T-C | 10103829-T-C | ** | ||||||||
7200091-A-G | 7332050-A-G | ** | ||||||||
7425135-C-A | 7557094-C-A | ** | ||||||||
7424468-A-C | 7556427-A-C | ** | ||||||||
7341459-G-T | 7473418-G-T | ** | ||||||||
7337076-C-A | 7469035-C-A | ** | ||||||||
7320256-G-A | 7452215-G-A | ** | ||||||||
7304588-C-A | 7436547-C-A | ** | ||||||||
7299156-A-T | 7431115-A-T | ** | ||||||||
7287830-G-A | 7419789-G-A | ** | ||||||||
7269948-A-T | 7401907-A-T | ** | ||||||||
7240795-A-C | 7372754-A-C | ** | ||||||||
7218317-C-G | 7350276-C-G | ** | ||||||||
7185521-C-A | 7317480-C-A | ** | ||||||||
7541427-T-TC | 7673386-T-TC | ** | ||||||||
7135180-T-C | 7267139-T-C | ** | ||||||||
7127363-G-A | 7259322-G-A | ** | ||||||||
7076610-C-T | 7208569-C-T | ** | ||||||||
7039543-G-A | 7171502-G-A | ** | ||||||||
7039499-G-A | 7171458-G-A | ** | ||||||||
6998053-C-A | 7130012-C-A | ** | ||||||||
6926403-G-T | 7058362-G-T | ** | ||||||||
6882404-C-A | 7014363-C-A | ** | ||||||||
6771712-C-A | 6903671-C-A | ** | ||||||||
6765639-GGTT-G | 6897598-GGTT-G | ** | ||||||||
6694534-G-A | 6826493-G-A | ** | ||||||||
6692159-T-C | 6824118-T-C | ** | ||||||||
7524664-C-A | 7656623-C-A | ** | ||||||||
7183707-C-A | 7315666-C-A | ** | ||||||||
7704904-C-A | 7836863-C-A | ** | ||||||||
8269816-A-T | 8401775-A-T | ** | ||||||||
9444871-C-A | 9607262-C-A | ** | ||||||||
7923780-CGGAGTTT-C | 8055739-CGGAGTTT-C | ** | ||||||||
9015833-A-G | 9178224-A-G | ** | ||||||||
8854346-G-T | 8986305-G-T | ** | ||||||||
9761143-A-T | 9923534-A-T | ** | ||||||||
9761234-C-T | 9923625-C-T | ** | ||||||||
9761235-T-C | 9923626-T-C | ** | ||||||||
9675047-T-C | 9837438-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
8786724-T-G | 8918683-T-G | ** | ||||||||
8720703-C-A | 8852662-C-A | ** | ||||||||
9900139-G-T | 10062530-G-T | ** | ||||||||
8822592-A-G | 8954551-A-G | ** | ||||||||
8092173-C-A | 8224132-C-A | ** | ||||||||
8216524-G-A | 8348483-G-A | ** | ||||||||
8112588-G-A | 8244547-G-A | ** | ||||||||
7990137-A-T | 8122096-A-T | ** | ||||||||
28725991-A-T | 26579844-A-T | *** | ||||||||
13448355-CCCCCT-C,CCCCC | 11292679-CCCCCT-C,CCCCC | *** | ||||||||
13488654-C-A | 11332978-C-A | *** | ||||||||
15874261-C-A | 13762381-C-A | *** | ||||||||
56850712-C-T | *** | |||||||||
18640859-TA-T | 16528979-TA-T | 10×A | *** | |||||||
16819011-ATATC-A,ATATATATATC | 14707131-ATATC-A,ATATATATATC | *** | ||||||||
26099827-GTCTCTC-G,GTC | 23953680-GTCTCTC-G,GTC | P1_Y1 | 27×TC | *** | ||||||
4100531-T-C | 4232490-T-C | *** | ||||||||
16707225-A-G | 14595345-A-G | *** | ||||||||
10888017-C-CTAA | *** | |||||||||
15963965-C-CT | 13852085-C-CT | 9×T | *** | |||||||
10648069-CTCCATTCCAT-C,CTCCAT | *** | |||||||||
7101772-TA-T | 7233731-TA-T | 10×A | *** | |||||||
9934825-G-A | 10097216-G-A | *** | ||||||||
13824831-A-T | 11704125-A-T | *** | ||||||||
13824829-G-T | 11704123-G-T | *** | ||||||||
13824823-G-T | 11704117-G-T | *** | ||||||||
16520858-T-C | 14408978-T-C | *** | ||||||||
28785750-T-A | 26639603-T-A | *** | ||||||||
9907195-C-A | 10069586-C-A | *** | ||||||||
28793361-G-A | 26647214-G-A | A16585 | *** | |||||||
10943039-T-A | *** | |||||||||
14787738-CTA-C | 12675808-CTA-C | *** | ||||||||
14285972-C-A | 12165266-C-A | *** | ||||||||
26566639-G-A | 24420492-G-A | P1_g2 | *** | |||||||
15688526-C-A | 13576646-C-A | *** | ||||||||
15778648-CT-C,CTT | 13666768-CT-C,CTT | 15×T | *** | |||||||
18929013-C-T | 16817133-C-T | *** | ||||||||
13489501-C-G | 11333825-C-G | *** | ||||||||
18190584-C-A | 16078704-C-A | *** | ||||||||
13488647-C-A | 11332971-C-A | *** | ||||||||
13487691-C-A | 11332015-C-A | *** | ||||||||
13474658-T-A | 11318982-T-A | *** | ||||||||
4547802-C-A | 4679761-C-A | *** | ||||||||
18759060-C-A | 16647180-C-A | *** | ||||||||
10772478-A-G | *** | |||||||||
13320129-C-A | 11164453-C-A | *** | ||||||||
10772498-C-G | *** | |||||||||
8274037-A-AT | 8405996-A-AT | *** | ||||||||
8550844-TAA-T,TAAA | 8682803-TAA-T,TAAA | 17×A | *** | |||||||
16199680-T-C | 14087800-T-C | *** | ||||||||
14422095-C-A | 12301370-C-A | *** | ||||||||
7058044-C-T | 7190003-C-T | 12×T | *** | |||||||
7167184-C-A | 7299143-C-A | *** | ||||||||
7142792-C-A | 7274751-C-A | *** | ||||||||
15395350-T-A | 13283470-T-A | *** | ||||||||
7142772-C-A | 7274731-C-A | *** | ||||||||
17142039-C-A | 15030159-C-A | *** | ||||||||
11025433-C-G,T | *** | |||||||||
11022114-T-C | *** | |||||||||
11001436-A-C,T | *** | |||||||||
10851058-T-A | *** | |||||||||
10795141-C-A | *** | |||||||||
2851992-GA-G | 2983951-GA-G | 11×A | *** | |||||||
28785761-G-A | 26639614-G-A | *** | ||||||||
10986962-C-A | *** | |||||||||
10986947-C-A | *** | |||||||||
13478524-C-T | 11322848-C-T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Big Tree Main Page